Mehmed Şakir Paşa, 1855 yılında Bursa'da doğmuş, Osmanlı İmparatorluğu'nun son dönemlerinde önemli görevler üstlenmiş bir devlet adamıdır.
Aslen Afyonkarahisarlı olan Kabaağaçlızâde ailesine mensuptur. Babası Miralay Mustafa Asım Bey, ağabeyi ise II. Abdülhamid döneminde sadrazamlık yapmış olan Ahmed Cevad Paşa'dır.
Anne ve babasının vefatının ardından ağabeyiyle birlikte askeri okula gönderilmiş, eğitimini tamamladıktan sonra çeşitli diplomatik görevlerde bulunmuştur.
1890 yılında Girit Valisi olarak atanmış, 1895'te ağabeyinin sadrazamlık görevinden alınmasını protesto ederek devlet görevinden istifa etmiştir.
İstifasının ardından Galatasaray Lisesi'nde gönüllü öğretmenlik yapmış ve tarih kitapları yazmaya yönelmiştir. Şakir Paşa, Fransızca ve Yunanca başta olmak üzere birçok dili bilmekteydi.
Eşi İsmet Hanım ile Girit'te tanışmış ve evlenmişlerdir. Bu evlilikten Cevat Şakir (Halikarnas Balıkçısı), Fahrelnissa Zeid ve Aliye Berger gibi Türk sanat ve edebiyatında önemli isimler yetişmiştir. 1914 yılında, Afyon'daki Kabaağaçlı çiftliğinde oğlu Cevat Şakir ile yaşadığı bir tartışma sırasında, Cevat Şakir'in silahından çıkan kurşunla hayatını kaybetmiştir. Olayın kaza sonucu gerçekleştiği kaydedilmiştir. Bu trajik olay, Şakir Paşa Ailesi'nin tarihindeki önemli dönüm noktalarından biridir.
